Обжаловать действие или же бездействие должностных лиц в суде представляется возможным только после того, как этот вопрос будет обжалован в налоговых органах (данное обстоятельство следует из 138 статьи, пункта 2 НК РФ). Исключением в данном случае являются незаконные акты, которые были приняты по факту рассмотрения жалоб. Также важно знать, что лицо вправе обжаловать незаконные акты федеральных органов, относящихся к исполнительной власти, в полномочия которых входит надзор и контроль в сфере налогообложения. В соответствии со статьей 176, пунктом 3 НК РФ отказать в возмещении НДС (или же частичном возмещении) можно лишь по факту камеральной проверки. Одновременно с этим лицо должно быть привлечено к ответственности. Вышеуказанные обстоятельства должны вступить в силу одновременно, обжаловаться вместе и оплачиваться государственной пошлиной в качестве единого требования. При этом важно помнить, что досудебное обжалование вопроса может быть применимо в случаях, когда необходимо либо привлечь к ответственности, либо отказать в привлечении.
Все незаконные акты, которые были приняты в исполнение, можно оспорить, если был нарушен порядок их принятия. При этом не может учитываться мотив необоснованно начисленных налоговых сумм или же вовсе грубое нарушение процесса вынесения решения о привлечении (либо отказе о привлечении) к ответственности. Если было вынесено решение полностью или частично отказать в возмещении НДС, то данное решение можно обжаловать в суде при том условии, что оно ранее было обжаловано в вышестоящем налоговом органе. При этом должна обязательно иметься жалоба от налогоплательщика, а также должны быть подвергнуты проверке все обстоятельства и доводы, которые могут служить законным основанием для того, что в возмещении следует отказать (либо же, чтобы, наоборот, привлечь к возмещению). Так выражается налоговая ответственность. Учитывая все вышеизложенные факты можно прийти к выводу, что однозначного решения вопроса, в принципе, не существует. Этому препятствуют определенные обстоятельства, которые более подробно описаны ниже. Во-первых, отсутствует однозначная судебная практика по данному вопросу. Наряду с этим законодатель не выражает официальной позиции, которая могла бы обозначить, нужно ли действительно останавливать процесс рассмотрения заявления, поступившего от налогоплательщика.
Во-вторых, имеется две позиции судов, которые явно друг другу противоречат. С одной стороны, суд обязан рассмотреть заявление о признании решения об отказе в возмещении незаконным. При этом налогоплательщик мог в досудебном порядке оспорить решение об отказе в привлечении либо же, наоборот, в привлечении к ответственности. С другой стороны, суд может и вовсе не рассматривать заявление от налогоплательщика в том случае, если налогоплательщик в досудебном порядке оспорил решение о привлечении или не привлечении к ответственности.